264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_161 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  92.11 
 
 		 344 aa  646    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  100 
 
 		 344 aa  704    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  56.85 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  55.49 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  51.04 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  51.04 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  54.01 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  49.12 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.25 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  50.6 
 
 		 344 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  50.6 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  48.67 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  49.12 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  47.66 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  50.44 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  48.27 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.55 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  45.97 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  47.01 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  49.26 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  45.56 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  50.15 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  46.71 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  48.22 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  52.25 
 
 		 339 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  45.56 
 
 		 334 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  44.38 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  48.52 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  47.15 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  46.71 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  47.15 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  46.71 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  48.21 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  46.71 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  46.85 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  46.49 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  47.02 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  46.61 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  46.55 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  45.91 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  46.61 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  45.22 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  43.95 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  44.05 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  45.61 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  45.9 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  44.86 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  48.54 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  46.2 
 
 		 461 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  42.94 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  46.61 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  47.37 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  43.84 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  43.77 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  47.51 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  47.51 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  47.63 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  47.63 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  46.31 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  47.51 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  46.18 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  44.51 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.02 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  47.51 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  47.37 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  46.82 
 
 		 458 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  43.94 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.64 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  44.19 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  46.31 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  45.32 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  45.59 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  45.32 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  45.32 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  46.76 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  45.97 
 
 		 352 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  43.47 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  49.25 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  46.45 
 
 		 345 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.51 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  48.82 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  49.25 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  49.25 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  45.4 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  49.25 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  49.25 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  43.26 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  41.16 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  45.8 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.51 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  45.48 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  44.82 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.02 
 
 		 352 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  42.36 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  44.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.11 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45.54 
 
 		 334 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  47.74 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  47.74 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>