More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3653 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  881    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  65.47 
 
 
447 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 
454 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
451 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.78 
 
 
447 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  31.71 
 
 
454 aa  201  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.23 
 
 
457 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.98 
 
 
455 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  32.25 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.2 
 
 
455 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  31.47 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.04 
 
 
451 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.81 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  31.24 
 
 
433 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  32.02 
 
 
433 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.98 
 
 
399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  32.05 
 
 
433 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  32.05 
 
 
436 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
399 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  31.14 
 
 
446 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  32.05 
 
 
436 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.17 
 
 
468 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  32.35 
 
 
433 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  30.84 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  30.62 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.87 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  30.04 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  31.88 
 
 
458 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.33 
 
 
399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  30.4 
 
 
442 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  30.48 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  29.77 
 
 
452 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.6 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  28.95 
 
 
445 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.78 
 
 
399 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
451 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.46 
 
 
449 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  30.14 
 
 
443 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.71 
 
 
474 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.05 
 
 
473 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  33.07 
 
 
436 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
451 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  30.69 
 
 
449 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.77 
 
 
474 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
473 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  28.7 
 
 
446 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.23 
 
 
476 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.19 
 
 
438 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.75 
 
 
474 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.77 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  28.51 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  28.7 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  31.59 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.6 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
478 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  31.34 
 
 
465 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  31.57 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.96 
 
 
454 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.5 
 
 
477 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  29.56 
 
 
452 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  27.35 
 
 
465 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  31.27 
 
 
467 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.97 
 
 
460 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.25 
 
 
459 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  31.27 
 
 
467 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
439 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  31.27 
 
 
467 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
404 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
456 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
439 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  26.55 
 
 
459 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  30.28 
 
 
449 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.92 
 
 
464 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.01 
 
 
463 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.18 
 
 
467 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.21 
 
 
478 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
435 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
461 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  29.12 
 
 
437 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.28 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>