More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0317 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0245  hypothetical protein  39.44 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.982194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0472  C-type cytochrome  39.52 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  41.57 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  29.27 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02287  cytochrome C6  43.02 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  43.37 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.36 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  33.54 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  39.02 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1534  putative cytochrome C6  30.36 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0283765  normal  0.795594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  37.63 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  43.21 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.76 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  37.86 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  37.78 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.58 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  38.3 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  44.09 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  44.09 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  38.3 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  44.09 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  41.23 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.89 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  37.36 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  43.01 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  34.41 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 518 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  37.63 
 
 		 538 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 419 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  38.53 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  36.73 
 
 		 557 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  40.22 
 
 		 513 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  34.74 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  39.05 
 
 		 525 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  35.4 
 
 		 434 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  40.86 
 
 		 528 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.88 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.53 
 
 		 531 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 143 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 389 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  35.45 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 532 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  35.42 
 
 		 366 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  33.65 
 
 		 438 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 532 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 519 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  34.51 
 
 		 513 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  36.56 
 
 		 544 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 532 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  33.67 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 444 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 535 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  37.37 
 
 		 511 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 532 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  35.78 
 
 		 535 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 728 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.17 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  44.3 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 378 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.75 
 
 		 513 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  35.42 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  33.78 
 
 		 119 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  44.3 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.97 
 
 		 421 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.44 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  33.63 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.87 
 
 		 469 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  39.08 
 
 		 524 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>