115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0280 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
305 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
291 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
298 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
301 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  36.57 
 
 
335 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
293 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
308 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
212 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.5 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
198 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  56 
 
 
258 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
197 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  24.36 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  39.58 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  27.04 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.12 
 
 
250 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.12 
 
 
250 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.71 
 
 
258 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.71 
 
 
258 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.91 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.44 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  28.12 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.9 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.49 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
264 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.04 
 
 
334 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  32.51 
 
 
232 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  24.62 
 
 
207 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  29.57 
 
 
754 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
301 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0966  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.53 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  22.78 
 
 
196 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
234 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.29 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.15 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.96 
 
 
266 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 
211 aa  45.8  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  29.24 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
209 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.08 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.55 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.25 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.53 
 
 
201 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  29.45 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  28.26 
 
 
210 aa  43.5  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 
207 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1895  beta-lactamase domain-containing protein  52.63 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.6 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.83 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0879  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.09 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
210 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
221 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  37.88 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  37.7 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  38 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  24.72 
 
 
246 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>