82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0656 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 301 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  54.35 
 
 		 526 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  25.25 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  24.65 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  28.09 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  25.59 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.13 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  25.08 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  23.43 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  26.36 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  25.19 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  22.97 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  25.19 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  22.97 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  22.96 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  24.8 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  23.6 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  22.8 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  25.58 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.53 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.92 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  22.31 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  21.43 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  21.46 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.14 
 
 		 637 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  21.94 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.66 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  20.13 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  22.34 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  21.52 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  33.87 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.51 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  21.3 
 
 		 425 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.74 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.26 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>