More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5733 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  74.94 
 
 		 423 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 423 aa  876    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  64.69 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  64.54 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  62.21 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  60.8 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  62.29 
 
 		 419 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  61.87 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  54.63 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.15 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.57 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  50.12 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  48.59 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 447 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.79 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.55 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  48.7 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.2 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.55 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  48.32 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  48.68 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  45.99 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  46.63 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  43.55 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  44.92 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  46.34 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  48.15 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  48.9 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.57 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  46.86 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  45.32 
 
 		 446 aa  362  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  46.78 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  44.87 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  46.02 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  45.3 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  45.54 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  45.08 
 
 		 432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  43.65 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  46.02 
 
 		 528 aa  356  5e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.34 
 
 		 726 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  44 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  46.41 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  45.11 
 
 		 438 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.22 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>