119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2610 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.5 
 
 		 722 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  60.29 
 
 		 764 aa  981    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  54.64 
 
 		 797 aa  824    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1580    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  56.58 
 
 		 764 aa  899    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  60.61 
 
 		 758 aa  979    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.86 
 
 		 748 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  38.84 
 
 		 761 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.03 
 
 		 641 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  38.51 
 
 		 784 aa  291  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.76 
 
 		 600 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  36.2 
 
 		 763 aa  208  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.59 
 
 		 435 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.06 
 
 		 466 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.51 
 
 		 448 aa  100  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.16 
 
 		 472 aa  93.2  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 475 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 414 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  33.74 
 
 		 606 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  24.09 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  35.81 
 
 		 491 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  36.97 
 
 		 445 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  36.55 
 
 		 457 aa  84  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  34.19 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  22.37 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.11 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.27 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.42 
 
 		 595 aa  77.8  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  32.7 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.48 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.62 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.1 
 
 		 584 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  33.85 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.61 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.82 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  32.41 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.74 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.27 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 454 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.14 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  30 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  31.67 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  27.05 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 460 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  33.61 
 
 		 531 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  23.8 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 411 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  29.45 
 
 		 530 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28.86 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.84 
 
 		 585 aa  57  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 433 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 468 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  27.01 
 
 		 595 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  29.29 
 
 		 669 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.78 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  34.58 
 
 		 549 aa  55.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  26.5 
 
 		 514 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  23.77 
 
 		 621 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.2 
 
 		 437 aa  54.3  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 676 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.2 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.08 
 
 		 595 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 538 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  27.66 
 
 		 527 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.99 
 
 		 668 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  26.23 
 
 		 680 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  27.94 
 
 		 532 aa  51.6  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  27.56 
 
 		 691 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  34.48 
 
 		 465 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.25 
 
 		 540 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  36.67 
 
 		 568 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 534 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 537 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  23.36 
 
 		 696 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  25 
 
 		 706 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.47 
 
 		 595 aa  48.5  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 455 aa  48.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 402 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  28.46 
 
 		 532 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  47.5 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.06 
 
 		 547 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 460 aa  47.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.5 
 
 		 519 aa  47.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1583  heterodisulfide reductase, subunit A/hydrogenase, delta subunit, putative  41.94 
 
 		 750 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  47.5 
 
 		 476 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  51.28 
 
 		 464 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  27.27 
 
 		 679 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>