More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1480 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  100 
 
 
438 aa  862    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  46.15 
 
 
435 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  44.14 
 
 
435 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  44.06 
 
 
446 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  41.96 
 
 
428 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  40.61 
 
 
426 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  47.66 
 
 
433 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  42.56 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  41.49 
 
 
446 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  41.72 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  38.82 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  39.11 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  36.62 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  37.53 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  39.11 
 
 
425 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  39.11 
 
 
425 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  37.35 
 
 
436 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  36.74 
 
 
433 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  36.74 
 
 
433 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  38.17 
 
 
425 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  35.12 
 
 
433 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  36.92 
 
 
428 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  39.03 
 
 
438 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  38.75 
 
 
427 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  37.27 
 
 
432 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  36.38 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  36.89 
 
 
449 aa  270  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  35.73 
 
 
427 aa  269  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  36.63 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  38.08 
 
 
428 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  35.73 
 
 
427 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  38.08 
 
 
428 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.56 
 
 
488 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  37.82 
 
 
478 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  34.04 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  32.17 
 
 
460 aa  233  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  35.15 
 
 
468 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  32.41 
 
 
435 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.31 
 
 
439 aa  230  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  32.49 
 
 
483 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.89 
 
 
471 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.7 
 
 
431 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  32.18 
 
 
454 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  31.48 
 
 
435 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  32.99 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  33.8 
 
 
481 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  31.58 
 
 
440 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  30.98 
 
 
507 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  31.7 
 
 
463 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.48 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  34.1 
 
 
430 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  32.71 
 
 
466 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  32.63 
 
 
500 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  30.85 
 
 
447 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  30.8 
 
 
461 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.52 
 
 
447 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  33.49 
 
 
429 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  33.49 
 
 
429 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.88 
 
 
437 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  33.26 
 
 
429 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.31 
 
 
485 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.07 
 
 
433 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.63 
 
 
450 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  30.84 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.87 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  29.14 
 
 
491 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  30.87 
 
 
479 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  30.02 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  30.02 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  30.02 
 
 
482 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  32.95 
 
 
463 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  31.21 
 
 
479 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  30.61 
 
 
473 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.49 
 
 
448 aa  195  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  31.62 
 
 
458 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.98 
 
 
448 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.22 
 
 
439 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  31.4 
 
 
474 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.21 
 
 
466 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  29.76 
 
 
469 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  28.5 
 
 
465 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  28.88 
 
 
500 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  29.11 
 
 
471 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  28.47 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  29.7 
 
 
449 aa  190  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  30.1 
 
 
437 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  26.87 
 
 
513 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  29.79 
 
 
474 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  33.03 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.29 
 
 
447 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  30.05 
 
 
481 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  30.1 
 
 
477 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.4 
 
 
435 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>