More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1603 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 337 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  30.16 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  31.79 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  29.32 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.74 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  34.54 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  29.28 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  29.28 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  32.03 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  29.55 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  33 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  32.57 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  28.38 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  27.45 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  28.57 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 		 289 aa  99.8  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.48 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  25.99 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  23.92 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 308 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  24.42 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  28.34 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  24.42 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 		 306 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 291 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  24.09 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 295 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  27.69 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  23.25 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  23.76 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  28.39 
 
 		 303 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.43 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  25.73 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  23.2 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  23.2 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  23.26 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  23.2 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  27.67 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>