104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1574 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  100 
 
 		 175 aa  347  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  67.43 
 
 		 175 aa  239  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  66.86 
 
 		 175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  66.29 
 
 		 175 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  66.47 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  60.45 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  59.55 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  58.99 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  54.24 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  54.34 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  44.51 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.57 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  38.42 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  37.06 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  30.64 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  32 
 
 		 181 aa  84.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  30.06 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  34.5 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  35.93 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  32 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  38.54 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  33.53 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  41.41 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  34.65 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  29.09 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  29.09 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  29.29 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  30.6 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.21 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.21 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.17 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  32.71 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.03 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  28.57 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  43.1 
 
 		 779 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  32.11 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  32.11 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  37.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  27.08 
 
 		 907 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.92 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  27.74 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29.79 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.01 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  29.01 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.01 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  34.57 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.6 
 
 		 478 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.75 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  30.85 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  23.7 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.07 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  28.57 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.09 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.03 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  29.2 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  34.94 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.59 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  33.04 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  26.6 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.38 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  35.96 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.68 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  41.86 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.43 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.26 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  33.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  30.08 
 
 		 169 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  30.85 
 
 		 158 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  24.53 
 
 		 466 aa  42  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  31.91 
 
 		 159 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  37.04 
 
 		 136 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  36.21 
 
 		 205 aa  42  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  33.9 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  29.41 
 
 		 181 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.26 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.21 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.73 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.05 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  30.43 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  35.94 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  30.85 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.18 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.79 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.26 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0056  CheW protein  32 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  26.21 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>