More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0219 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 		 384 aa  730    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.26 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  32.05 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  32.08 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  32.77 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  31.52 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.53 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  31.79 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.51 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  33.51 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.55 
 
 		 372 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  29.79 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  33.33 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  33.33 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  32.78 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.15 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  28.14 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  32.5 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  33.15 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  27.44 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  26.9 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  31.58 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  30.1 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.12 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  30.23 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.35 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  31.67 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  28.49 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  28.34 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  32.57 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.65 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  31.03 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.71 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.71 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.81 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  31.56 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  27.01 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  29.89 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  33.01 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  29.79 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  30.71 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  30.15 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.49 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  30.59 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  24.93 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  30 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  27.99 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  25.68 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.53 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.53 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  32.8 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  26.14 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  27.52 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  31.83 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.78 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  24.36 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.65 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  31.85 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.67 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  31.18 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  28.46 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  28.25 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  34.59 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.72 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  28.95 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  29.78 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.86 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  32.77 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  32.69 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.94 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  30.52 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  28.18 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  28.42 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  32.13 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.74 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  29.78 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  24.36 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.54 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30.41 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.82 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.07 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  25.9 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  27.13 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  26.18 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  30.87 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.35 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  26.94 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  30.98 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  30.08 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.85 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02544  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.96 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0279642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  29.8 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.14 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>