54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1197 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  942    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  85.2 
 
 		 615 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  82.88 
 
 		 615 aa  718    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  90.02 
 
 		 613 aa  794    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  83.09 
 
 		 615 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  89.87 
 
 		 566 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  89.52 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  91.15 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  90.16 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  88.52 
 
 		 558 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  84.91 
 
 		 408 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  89.09 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  85 
 
 		 334 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  83.92 
 
 		 268 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  84.89 
 
 		 251 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  91.85 
 
 		 212 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2840  hypothetical protein  83.93 
 
 		 114 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00994271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2210  putative cytoplasmic protein  55.09 
 
 		 588 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  unclonable  1.13834e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1195  hypothetical protein  80.91 
 
 		 114 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2794  hypothetical protein  53.89 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3036  putative cytoplasmic protein  52.21 
 
 		 135 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  63.16 
 
 		 209 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  39.58 
 
 		 1559 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  39.58 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  40.15 
 
 		 701 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  26.82 
 
 		 575 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  25.81 
 
 		 581 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  27.1 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2212  putative cytoplasmic protein  40.94 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000235333  hitchhiker  2.3052800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  36.13 
 
 		 6274 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.5 
 
 		 1568 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  35.82 
 
 		 2486 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  37.67 
 
 		 614 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  38.1 
 
 		 2286 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  39.58 
 
 		 2585 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  32.89 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  32.59 
 
 		 3073 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  35.03 
 
 		 3689 aa  68.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2787  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000546182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  94.83 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2789  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000416361  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  32.7 
 
 		 848 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  33.65 
 
 		 997 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 1391 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  31.45 
 
 		 2615 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  28.66 
 
 		 1140 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  32.1 
 
 		 2387 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 2296 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  32.47 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.19 
 
 		 2290 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 3273 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  23.81 
 
 		 1345 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4048  hypothetical protein  28.91 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.02 
 
 		 2094 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>