95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4617 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 1025 aa  2138    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  37.14 
 
 		 846 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  35.68 
 
 		 614 aa  338  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  32.93 
 
 		 771 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  31.56 
 
 		 641 aa  301  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  33.12 
 
 		 803 aa  293  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  31.75 
 
 		 765 aa  274  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  27.87 
 
 		 955 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  29.35 
 
 		 760 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  31.15 
 
 		 795 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  30.64 
 
 		 795 aa  261  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  31.32 
 
 		 844 aa  260  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  30.64 
 
 		 795 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  30.83 
 
 		 792 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  32.08 
 
 		 881 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  26.69 
 
 		 597 aa  221  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  28.74 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  28.42 
 
 		 744 aa  180  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  26.18 
 
 		 752 aa  153  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  34.9 
 
 		 736 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  24.66 
 
 		 749 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26 
 
 		 607 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  24.4 
 
 		 596 aa  129  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.74 
 
 		 602 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  22.38 
 
 		 652 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  24.44 
 
 		 638 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  23.25 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  25.13 
 
 		 680 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  22.84 
 
 		 659 aa  101  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  26.25 
 
 		 634 aa  100  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  24.4 
 
 		 634 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  24.14 
 
 		 711 aa  97.8  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  25.39 
 
 		 666 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  24.25 
 
 		 648 aa  95.1  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  23.79 
 
 		 640 aa  91.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  24.93 
 
 		 617 aa  90.5  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  25.35 
 
 		 628 aa  89.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  23.58 
 
 		 684 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  24.06 
 
 		 800 aa  89.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  25.2 
 
 		 647 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  27.56 
 
 		 640 aa  89.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  31.64 
 
 		 767 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.49 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  24.48 
 
 		 646 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.9 
 
 		 739 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  22.84 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.67 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.13 
 
 		 656 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  26.27 
 
 		 679 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  23.14 
 
 		 620 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  22.29 
 
 		 742 aa  79.7  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  22.64 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  22.75 
 
 		 654 aa  79.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  21.63 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  24.04 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  24 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  21.63 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  21.39 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  21.63 
 
 		 651 aa  77.8  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  19.79 
 
 		 656 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  19.57 
 
 		 656 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  22.36 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  23.01 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.49 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  20.42 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  20.42 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  23.77 
 
 		 640 aa  74.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  21.52 
 
 		 648 aa  73.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  24.46 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  23.4 
 
 		 629 aa  72.4  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  22.68 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  22.25 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  27.54 
 
 		 741 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  24.05 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  26.95 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  26.95 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  21.22 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.2 
 
 		 677 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  25 
 
 		 1323 aa  67.4  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  25.1 
 
 		 669 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  23.41 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  24.27 
 
 		 684 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  21.66 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  27.34 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  21.94 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  23.75 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.71 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  22.92 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  23.31 
 
 		 718 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  24.14 
 
 		 397 aa  56.2  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.26 
 
 		 4433 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  23.5 
 
 		 963 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  25.88 
 
 		 247 aa  47.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1931 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>