152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0230 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  322  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  48.45 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 
324 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
157 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
157 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
157 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  51.25 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
153 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  50 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
174 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
163 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  49.08 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  48.15 
 
 
154 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
165 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
155 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 
168 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
155 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
155 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 
153 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  45.68 
 
 
154 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
162 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
154 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  39.75 
 
 
172 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
160 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.25 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.25 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  32.61 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  38.71 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  38.71 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  38.71 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  38.71 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  40.79 
 
 
158 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
167 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.16 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  37.66 
 
 
153 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  55.88 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.42 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.06 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.42 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
184 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.41 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.92 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.93 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.17 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  48.08 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  29.84 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  48.98 
 
 
473 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  48.08 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  47.92 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  40 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  48.08 
 
 
316 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  41.94 
 
 
326 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.62 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  52.94 
 
 
148 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
177 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
229 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  40 
 
 
143 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
183 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  46.15 
 
 
314 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05488  hypothetical protein  37.14 
 
 
474 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>