More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3399 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
362 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  37.41 
 
 
354 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
378 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  29.97 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  30.7 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 
373 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 
378 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
392 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  39.06 
 
 
365 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.61 
 
 
370 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
395 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
268 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
268 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  29.61 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  36.76 
 
 
493 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  41.18 
 
 
504 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  34.55 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  34.55 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  34.55 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.18 
 
 
500 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
480 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 
341 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  28.57 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  34.32 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.27 
 
 
264 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
502 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 
280 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  38.41 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  31.7 
 
 
568 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  31.05 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.4 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  31.19 
 
 
474 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  32.5 
 
 
518 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.15 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.17 
 
 
569 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.17 
 
 
567 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 
632 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  29.64 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  36.5 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  34.83 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.5 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 
487 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  28.11 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 
486 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  28.69 
 
 
483 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 
489 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 
503 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  26.24 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  32.41 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.84 
 
 
484 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.44 
 
 
479 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  31.25 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.68 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.11 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 
489 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  34.22 
 
 
549 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  36.3 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.19 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  28.49 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  30.47 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  27.41 
 
 
550 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  37.78 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  37.36 
 
 
500 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  38.69 
 
 
589 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33.82 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  38.69 
 
 
589 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  38.69 
 
 
572 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>