49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0033 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  79.86 
 
 
591 aa  915  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1182  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.57 
 
 
575 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  34.8 
 
 
526 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.56 
 
 
575 aa  175  2e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  32.79 
 
 
659 aa  173  8e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  33.21 
 
 
665 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  33.13 
 
 
518 aa  170  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.78669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  33.04 
 
 
655 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  33.84 
 
 
572 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 
541 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  30.04 
 
 
516 aa  127  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.7 
 
 
530 aa  110  7e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  31.77 
 
 
558 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  3.00518e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  30.26 
 
 
601 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.40285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  34.84 
 
 
302 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.41 
 
 
2192 aa  86.3  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  31.59 
 
 
593 aa  84  7e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.24226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  25.13 
 
 
593 aa  78.6  3e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 
759 aa  79  3e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.36 
 
 
767 aa  77  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  30.09 
 
 
384 aa  73.6  9e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  30.51 
 
 
362 aa  69.7  1e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  28.9 
 
 
527 aa  68.9  3e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  23.47 
 
 
852 aa  63.9  8e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  30.65 
 
 
1010 aa  60.8  6e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  30.25 
 
 
546 aa  60.8  7e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  25.65 
 
 
464 aa  59.7  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  26.49 
 
 
483 aa  59.3  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  28.62 
 
 
461 aa  58.2  4e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  30.14 
 
 
545 aa  57  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  32.09 
 
 
422 aa  56.2  1e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  7.68502e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  27.62 
 
 
329 aa  53.9  8e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.75 
 
 
1061 aa  53.1  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  29.16 
 
 
466 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.36 
 
 
1234 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  26.75 
 
 
483 aa  47.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  27.57 
 
 
459 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.85185e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  30.65 
 
 
2042 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.43 
 
 
717 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  29.32 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  24.68 
 
 
913 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  38.51 
 
 
1318 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  31.25 
 
 
647 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.29 
 
 
1800 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.69 
 
 
1296 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.32 
 
 
1197 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.07 
 
 
1254 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  25.92 
 
 
454 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>