258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6499 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 319 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  52.66 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  49.52 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  38.51 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.65 
 
 		 637 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  34.9 
 
 		 644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  33.13 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.74 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 333 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.73 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.33 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.87 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.57 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.47 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.19 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  29.28 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  32.18 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  30.58 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.37 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  31.12 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.05 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.49 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  29.74 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.91 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.91 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.48 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.51 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.39 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  30.36 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.47 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.1 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>