More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1729 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.07 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  66.91 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  67.42 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.67 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  67.38 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  66.67 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.49 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  66.43 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  67.39 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.71 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  66.43 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.43 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.71 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  66.43 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.71 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.68 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  62.68 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.43 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  66.43 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.8 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.73 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  49.24 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.73 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  50.75 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  52.34 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  47.45 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  47.45 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  50.7 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  50.7 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  52.31 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  46.85 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  46.85 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  47.55 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  47.22 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  47.92 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  50 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  50.34 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.84 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  45.21 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  45.21 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  44.9 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  45.21 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  45.21 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  47.1 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  43.7 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.52 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  43.84 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  46.09 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.99 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 		 166 aa  94.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0260  colicin uptake protein TolR  41.61 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00469758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  37.88 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  43.8 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  40.46 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.57 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.38 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  43.7 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  43.24 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  42.03 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  42.03 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  44.29 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  39.01 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  41.61 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  41.61 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  40.46 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.55 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  40.15 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  39.69 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  41.61 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.45 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3089  colicin uptake protein TolR  43.48 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1247  colicin uptake protein TolR  43.48 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.62 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 		 162 aa  84.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  58.33 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  36.72 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  40.77 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  41.43 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  38.58 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>