More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1745 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  100 
 
 
546 aa  1113    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  55.29 
 
 
554 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  47.61 
 
 
572 aa  518  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  48.63 
 
 
548 aa  513  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  48.62 
 
 
595 aa  486  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  55.67 
 
 
605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  54.68 
 
 
614 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  54.68 
 
 
605 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  45.74 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  38.61 
 
 
550 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  34.73 
 
 
539 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  33.98 
 
 
564 aa  253  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.2 
 
 
601 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.78 
 
 
686 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.97 
 
 
544 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  36.51 
 
 
682 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  34.55 
 
 
594 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  33.98 
 
 
587 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.48 
 
 
595 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  34.81 
 
 
694 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  30.64 
 
 
598 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  34.06 
 
 
684 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  31.82 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  35.16 
 
 
591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40.37 
 
 
595 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.41 
 
 
599 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.4 
 
 
604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  37.11 
 
 
679 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.37 
 
 
595 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  38.12 
 
 
617 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.2 
 
 
638 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  34.19 
 
 
640 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.63 
 
 
626 aa  233  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.6 
 
 
571 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.28 
 
 
588 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.54 
 
 
604 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  32.88 
 
 
592 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.6 
 
 
598 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.88 
 
 
600 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.6 
 
 
598 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  32.56 
 
 
583 aa  230  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  33.33 
 
 
583 aa  229  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  33.33 
 
 
583 aa  229  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.35 
 
 
675 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  32.7 
 
 
660 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.07 
 
 
663 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.07 
 
 
655 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.33 
 
 
664 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.33 
 
 
598 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  37.39 
 
 
587 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.85 
 
 
651 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  38.01 
 
 
599 aa  227  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  33.85 
 
 
652 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  30.9 
 
 
588 aa  226  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  33.51 
 
 
677 aa  226  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  31.33 
 
 
578 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  29.42 
 
 
599 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.35 
 
 
584 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  32.15 
 
 
645 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  32.55 
 
 
663 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  34.35 
 
 
634 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  35.66 
 
 
637 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.92 
 
 
583 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.13 
 
 
598 aa  223  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  33.86 
 
 
587 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  32.49 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.32 
 
 
605 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  35.34 
 
 
677 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  35.95 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  33.33 
 
 
655 aa  222  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  35.6 
 
 
677 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  34.2 
 
 
700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.36 
 
 
600 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.42 
 
 
660 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  33.49 
 
 
602 aa  221  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  33.01 
 
 
578 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.64 
 
 
660 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  35.9 
 
 
535 aa  220  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.16 
 
 
660 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  30.88 
 
 
617 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.24 
 
 
582 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  32.92 
 
 
577 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  33.02 
 
 
636 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.16 
 
 
660 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.27 
 
 
646 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.45 
 
 
587 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.27 
 
 
646 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  38.21 
 
 
565 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.01 
 
 
613 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  31.06 
 
 
618 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  31.84 
 
 
573 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  32.14 
 
 
583 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.31 
 
 
640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  35.08 
 
 
677 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>