More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0726 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 388 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  70.32 
 
 		 384 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  60.81 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  59.21 
 
 		 382 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  59.21 
 
 		 382 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  62.73 
 
 		 382 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  62.73 
 
 		 382 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  58.21 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  62.12 
 
 		 384 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  58.05 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  65.91 
 
 		 269 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  55.98 
 
 		 273 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  53.05 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  51.25 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  53.44 
 
 		 272 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  52.53 
 
 		 280 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  53.44 
 
 		 272 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  43.75 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.04 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.51 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.38 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.35 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.81 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.47 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.83 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  31.77 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.73 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.42 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  34.46 
 
 		 347 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.83 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.67 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  28.17 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.85 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.79 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 		 300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  32.06 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.92 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  30.58 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  26.21 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  31.5 
 
 		 267 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.26 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.01 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.06 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 		 311 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  31.85 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  25.96 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  49.54 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.72 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  28.67 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  23.78 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.63 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.72 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  23.49 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  24.86 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  25.82 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  25.37 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  25.15 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  25.15 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  24.93 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 		 511 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  25.15 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.49 
 
 		 524 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  26.5 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  26.12 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.64 
 
 		 528 aa  99.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  26.36 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  25.07 
 
 		 532 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.25 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>