260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6914 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1394    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  30.57 
 
 		 572 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 976 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  64.71 
 
 		 965 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 971 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 972 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 989 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 971 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 986 aa  104  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 971 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  62.35 
 
 		 972 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  62.35 
 
 		 971 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  62.35 
 
 		 969 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  27.61 
 
 		 583 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  60.76 
 
 		 953 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  22.77 
 
 		 573 aa  91.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 991 aa  90.5  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 943 aa  90.5  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 943 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 968 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 978 aa  88.2  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 		 968 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 943 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 984 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  42.98 
 
 		 907 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  55 
 
 		 990 aa  84  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 948 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.88 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 904 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 979 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 964 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 964 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 876 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 964 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 966 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 917 aa  76.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 992 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 920 aa  75.5  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  28.29 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 875 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 875 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  44.58 
 
 		 901 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  47.67 
 
 		 853 aa  70.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  21.86 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  44.71 
 
 		 898 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  42.17 
 
 		 899 aa  68.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  42.17 
 
 		 898 aa  67.8  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  21.49 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  42.17 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  23.31 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  24.04 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  45.35 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  24.31 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  39.76 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  22.14 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  40.48 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  38.1 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  40.48 
 
 		 892 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  40.48 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  40.48 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  40.48 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  43.02 
 
 		 894 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.84 
 
 		 885 aa  63.9  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  45 
 
 		 880 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  41.46 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  42.86 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 884 aa  62  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  44.74 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  40.74 
 
 		 843 aa  61.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 889 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 880 aa  60.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  42.35 
 
 		 889 aa  60.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  41.57 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 885 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  22.63 
 
 		 602 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  23.03 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 885 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 885 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  38.75 
 
 		 892 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  38.75 
 
 		 892 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>