91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5986 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  51.1 
 
 
238 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  30.94 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  25.93 
 
 
720 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.93 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.46 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  30.05 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  28.81 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  27.64 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.53 
 
 
691 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  22.55 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  34.44 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  23.4 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  32.91 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  32.52 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.63 
 
 
772 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  24.86 
 
 
361 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  29 
 
 
580 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.44 
 
 
770 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.44 
 
 
770 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  29.49 
 
 
770 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  26.67 
 
 
566 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  29.52 
 
 
768 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  29.49 
 
 
770 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  24.24 
 
 
770 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  23.15 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  25.81 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  31.1 
 
 
449 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  28.14 
 
 
566 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  30.06 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.56 
 
 
769 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  29.45 
 
 
178 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  30.54 
 
 
566 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.71 
 
 
566 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0104  hypothetical protein  27.07 
 
 
390 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.432499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.77 
 
 
770 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  25.24 
 
 
566 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.11 
 
 
769 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  28.24 
 
 
566 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  28.24 
 
 
566 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  24.88 
 
 
566 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.41 
 
 
769 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  24.7 
 
 
577 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  23.01 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0598  hypothetical protein  29.28 
 
 
342 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  22.5 
 
 
534 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  23.38 
 
 
230 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  29.7 
 
 
171 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  23.49 
 
 
577 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  23.49 
 
 
577 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  26.39 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  29.33 
 
 
602 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  27.34 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  23.89 
 
 
722 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  23.89 
 
 
722 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  23.38 
 
 
722 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  23.38 
 
 
722 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  26.63 
 
 
755 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  29.24 
 
 
424 aa  49.7  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  24.87 
 
 
816 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  22 
 
 
576 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  26.48 
 
 
755 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  28.23 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  24.86 
 
 
816 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  22 
 
 
576 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.49 
 
 
746 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0761  hypothetical protein  21.74 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  22 
 
 
576 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  26.03 
 
 
757 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3344  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000000293232  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  23.89 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  20.75 
 
 
838 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  24.71 
 
 
577 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  20.75 
 
 
838 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  23.89 
 
 
580 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  24.87 
 
 
816 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  27.43 
 
 
818 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3699  hypothetical protein  23.65 
 
 
568 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000308051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30 
 
 
590 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  30.33 
 
 
621 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  23.86 
 
 
576 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  26.74 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  26.61 
 
 
823 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.93 
 
 
159 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  26.77 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0010  hypothetical protein  25.3 
 
 
398 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  26.28 
 
 
759 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  22.3 
 
 
836 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  24.34 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  19.27 
 
 
519 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  26.29 
 
 
838 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>