175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  100 
 
 
469 aa  964    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.71 
 
 
534 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.93 
 
 
527 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.16 
 
 
762 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.65 
 
 
546 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.22 
 
 
526 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.08 
 
 
553 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.82 
 
 
542 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.69 
 
 
534 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.95 
 
 
613 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.86 
 
 
505 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.14 
 
 
795 aa  343  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.58 
 
 
779 aa  343  5e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.76 
 
 
790 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.67 
 
 
525 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.91 
 
 
609 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.19 
 
 
905 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.05 
 
 
618 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.06 
 
 
775 aa  336  5.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  38.22 
 
 
795 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  41.59 
 
 
543 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.8 
 
 
774 aa  330  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.21 
 
 
821 aa  329  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.61 
 
 
634 aa  329  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  39.6 
 
 
777 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.03 
 
 
533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.2 
 
 
422 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.4 
 
 
766 aa  326  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.51 
 
 
781 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.24 
 
 
772 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40.51 
 
 
736 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.18 
 
 
545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.18 
 
 
614 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 
628 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.45 
 
 
613 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.21 
 
 
812 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.78 
 
 
549 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.49 
 
 
785 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 
605 aa  305  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 
812 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.64 
 
 
776 aa  300  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.11 
 
 
447 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.97 
 
 
760 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 
655 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 
779 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.51 
 
 
639 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.05 
 
 
639 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 
618 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  37.68 
 
 
602 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 
637 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 
765 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 
834 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.17 
 
 
481 aa  270  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
549 aa  260  4e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.75 
 
 
493 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 
504 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.43 
 
 
529 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
665 aa  237  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.77 
 
 
518 aa  232  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.8 
 
 
636 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.09 
 
 
811 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 
683 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.28 
 
 
547 aa  227  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
627 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.42 
 
 
688 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
639 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 
515 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.8 
 
 
636 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 
797 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.87 
 
 
500 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.47 
 
 
558 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 
639 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 
1140 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
584 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.23 
 
 
794 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 
593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.04 
 
 
688 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 
533 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.81 
 
 
884 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
673 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.84 
 
 
807 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.52 
 
 
673 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 
528 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.41 
 
 
525 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
820 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.26 
 
 
858 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.6 
 
 
888 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 
676 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  28.22 
 
 
896 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.98 
 
 
816 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.41 
 
 
906 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
530 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.77 
 
 
489 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.45 
 
 
889 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
857 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 
852 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  27.22 
 
 
833 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  27.04 
 
 
833 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  27.04 
 
 
856 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  27.22 
 
 
836 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>