47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1064 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  38.25 
 
 
231 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  39.08 
 
 
234 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  36.45 
 
 
242 aa  120  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  38.51 
 
 
224 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  35.16 
 
 
242 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  34.39 
 
 
234 aa  115  4e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85542e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  35.82 
 
 
228 aa  115  7e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  36.31 
 
 
222 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  35.71 
 
 
229 aa  108  7e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  35.84 
 
 
230 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  32.7 
 
 
203 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  31.41 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  31.25 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  31.35 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  35.71 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  35.71 
 
 
232 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  33.51 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  34.18 
 
 
212 aa  83.6  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  32.8 
 
 
213 aa  71.6  9e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  34.26 
 
 
215 aa  59.7  3e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  30.71 
 
 
233 aa  59.3  5e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  30.81 
 
 
202 aa  58.9  6e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  28.82 
 
 
191 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  30.77 
 
 
232 aa  57  2e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33509e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  29.17 
 
 
204 aa  53.9  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  31.17 
 
 
227 aa  52.8  4e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  41.54 
 
 
235 aa  52  7e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  43.94 
 
 
226 aa  51.2  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  40.28 
 
 
282 aa  50.1  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  40.3 
 
 
225 aa  48.9  6e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  39.71 
 
 
227 aa  48.5  7e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  33.82 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  34.92 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.35 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.66 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  40 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  40 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  39.68 
 
 
237 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  32.79 
 
 
291 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
216 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>