More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0148 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  94 
 
 
350 aa  665  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  94 
 
 
350 aa  665  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
350 aa  703  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  93.71 
 
 
350 aa  664  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  36.6 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  35.71 
 
 
372 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  35.96 
 
 
387 aa  183  4e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  33.93 
 
 
350 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  31.93 
 
 
354 aa  145  7e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  32.77 
 
 
417 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  34.28 
 
 
362 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  33.94 
 
 
363 aa  129  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  33.8 
 
 
364 aa  127  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  31.91 
 
 
379 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  31.91 
 
 
379 aa  125  8e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  31.91 
 
 
379 aa  125  8e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  31.91 
 
 
379 aa  125  8e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  31.91 
 
 
379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.84 
 
 
335 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  31.89 
 
 
382 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  33.51 
 
 
363 aa  122  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.88 
 
 
358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  39.45 
 
 
379 aa  120  4e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.75 
 
 
356 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  30.29 
 
 
367 aa  118  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  32.07 
 
 
346 aa  117  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.22 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  33.61 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.04312e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.22 
 
 
356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  33.33 
 
 
347 aa  117  4e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  29.22 
 
 
389 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  36.72 
 
 
376 aa  115  8e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  29.22 
 
 
389 aa  115  1e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  29.22 
 
 
389 aa  115  1e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  31.84 
 
 
365 aa  114  2e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  39.15 
 
 
394 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.66 
 
 
356 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34.02 
 
 
359 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  29.9 
 
 
383 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.75 
 
 
371 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  33.05 
 
 
357 aa  112  7e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  30.33 
 
 
358 aa  112  7e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  33.05 
 
 
357 aa  112  7e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.33 
 
 
402 aa  112  8e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  33.07 
 
 
358 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  31.28 
 
 
359 aa  112  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  5.84942e-05 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  28.65 
 
 
376 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  32.23 
 
 
367 aa  112  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  32.16 
 
 
357 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  33.23 
 
 
358 aa  111  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  32.32 
 
 
390 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  30.45 
 
 
363 aa  111  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.61 
 
 
383 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  32.32 
 
 
390 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  32.32 
 
 
390 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  29.73 
 
 
352 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  35.83 
 
 
394 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  31.65 
 
 
364 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  34.07 
 
 
357 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.65 
 
 
338 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  4.23032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  33.64 
 
 
351 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  30.17 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  33.86 
 
 
358 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  32.77 
 
 
371 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  2.47804e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  31.79 
 
 
359 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  30.68 
 
 
372 aa  110  4e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  33.55 
 
 
358 aa  110  4e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  29.85 
 
 
384 aa  110  4e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  33.55 
 
 
358 aa  110  4e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  33.55 
 
 
358 aa  110  4e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  34.07 
 
 
357 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  30.55 
 
 
374 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  33.76 
 
 
358 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.13 
 
 
354 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.21 
 
 
383 aa  109  7e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.19 
 
 
362 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  32.85 
 
 
340 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  34.09 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  34.09 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  34.09 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  31.82 
 
 
356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  31.82 
 
 
356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  34.09 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  29.34 
 
 
374 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  33.44 
 
 
358 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  33.44 
 
 
387 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  30.7 
 
 
372 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  32.58 
 
 
372 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  29.63 
 
 
391 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.6 
 
 
376 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  29.92 
 
 
372 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  31.36 
 
 
379 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  31.31 
 
 
376 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  33.23 
 
 
358 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  32.5 
 
 
356 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  29.68 
 
 
376 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  33.54 
 
 
358 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  31.31 
 
 
376 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.07 
 
 
390 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  39.04 
 
 
384 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>