More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2233 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  86.47 
 
 		 525 aa  887    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  86.45 
 
 		 517 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  75.94 
 
 		 557 aa  830    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  86.47 
 
 		 525 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  93.27 
 
 		 535 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  97.93 
 
 		 531 aa  979    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  86.28 
 
 		 525 aa  905    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  93.23 
 
 		 532 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  78.06 
 
 		 544 aa  811    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  78.81 
 
 		 538 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  99.62 
 
 		 532 aa  1082    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  86.47 
 
 		 525 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 532 aa  1084    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  86.45 
 
 		 517 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  93.46 
 
 		 535 aa  949    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  86.28 
 
 		 525 aa  886    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  99.81 
 
 		 532 aa  1082    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  86.45 
 
 		 517 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  70.66 
 
 		 418 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  70.92 
 
 		 418 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  72.91 
 
 		 390 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  62.86 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  64.34 
 
 		 422 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  65.08 
 
 		 385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  63.69 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  62.57 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  60.98 
 
 		 380 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 		 389 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  59.35 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  60.67 
 
 		 390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  61.07 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  61.62 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  60.98 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  58.08 
 
 		 377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  55.76 
 
 		 377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  58.84 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  56.45 
 
 		 382 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  48.25 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  50.79 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  49.87 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  46.53 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  45.93 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  51.27 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  48.56 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  51 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  49.74 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  50.58 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  44.27 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  44.05 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  49.06 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  46.73 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  47.21 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  50.58 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  48.35 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 		 518 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  45.76 
 
 		 384 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  49.86 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  49.3 
 
 		 518 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  49.01 
 
 		 518 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  47.58 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  49.3 
 
 		 518 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  45.21 
 
 		 374 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  47.98 
 
 		 374 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  45.24 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  46.51 
 
 		 366 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  47.06 
 
 		 401 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  47.06 
 
 		 401 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.98 
 
 		 401 aa  349  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  45.91 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  49.12 
 
 		 356 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  45.1 
 
 		 385 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  40.7 
 
 		 378 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  43.67 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  43.86 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  47.29 
 
 		 311 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 380 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 281 aa  259  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  44.7 
 
 		 308 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  44.4 
 
 		 320 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  39.16 
 
 		 304 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  39.64 
 
 		 279 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  39.47 
 
 		 284 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 		 295 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 		 284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  40.08 
 
 		 343 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  38.27 
 
 		 294 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  38.74 
 
 		 285 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  37.3 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  40.23 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  37.4 
 
 		 304 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  40.25 
 
 		 270 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 255 aa  179  8e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  36.56 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 254 aa  176  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  35.77 
 
 		 303 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  35.98 
 
 		 279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>