More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0078 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  99.73 
 
 
365 aa  709  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
365 aa  710  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
365 aa  710  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
365 aa  710  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
365 aa  710  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
365 aa  710  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  96.44 
 
 
365 aa  663  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  99.73 
 
 
365 aa  709  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  50.44 
 
 
360 aa  308  1e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  43.56 
 
 
397 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.92 
 
 
397 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  45.32 
 
 
403 aa  266  3e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  44.41 
 
 
403 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  43.5 
 
 
397 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  43.5 
 
 
397 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  41.13 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44 
 
 
368 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.54 
 
 
380 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  37.46 
 
 
365 aa  234  2e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  38.01 
 
 
380 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  35.56 
 
 
367 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  38.37 
 
 
366 aa  220  2e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.31728e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 
376 aa  220  4e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 
382 aa  219  4e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  40.98 
 
 
370 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  36.39 
 
 
371 aa  217  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 
382 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  36.02 
 
 
406 aa  213  3e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.37 
 
 
356 aa  213  5e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 
376 aa  213  6e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  34.07 
 
 
368 aa  212  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  38.74 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  34.07 
 
 
368 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 
373 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  34.53 
 
 
368 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  41.58 
 
 
365 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.19 
 
 
372 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  41.58 
 
 
365 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.58 
 
 
365 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  37.47 
 
 
376 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 
372 aa  201  2e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  36.31 
 
 
381 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.12 
 
 
370 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  35.5 
 
 
382 aa  198  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 
372 aa  198  1e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 
372 aa  197  2e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  40.84 
 
 
370 aa  196  5e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.94 
 
 
374 aa  193  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.83 
 
 
363 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.83 
 
 
363 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  1.5248e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 
365 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 
372 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.78 
 
 
375 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  33.52 
 
 
372 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  40.06 
 
 
377 aa  190  3e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  34.79 
 
 
376 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 
372 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 
383 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  32.87 
 
 
373 aa  189  6e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 
366 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 
379 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  32.89 
 
 
372 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  33.69 
 
 
382 aa  184  2e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.96 
 
 
377 aa  184  2e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
405 aa  184  2e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  33.05 
 
 
351 aa  183  4e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  32.76 
 
 
351 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 
369 aa  182  8e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.71819e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
394 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.39 
 
 
377 aa  181  3e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  36.86 
 
 
415 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  36.97 
 
 
383 aa  174  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  35.6 
 
 
370 aa  173  4e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 
354 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 
383 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.59 
 
 
362 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.88 
 
 
387 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 
340 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.91 
 
 
355 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 
360 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 
360 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 
385 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.32808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 
388 aa  167  3e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 
361 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.48395e-06  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  34.23 
 
 
360 aa  165  1e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  31.81 
 
 
390 aa  165  1e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 
378 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 
364 aa  164  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
361 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0787  hypothetical protein  28.07 
 
 
420 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 
394 aa  163  4e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0758  hypothetical protein  28.07 
 
 
420 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.46 
 
 
374 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33 
 
 
360 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 
391 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  33 
 
 
360 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  33.52 
 
 
391 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 
375 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 
360 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.42821e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>