More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1397 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1397  hflK protein  100 
 
 
382 aa  779    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  99.43 
 
 
384 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  91.5 
 
 
383 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  62.24 
 
 
376 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  66.27 
 
 
383 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  64.89 
 
 
362 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  58.33 
 
 
362 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  57.37 
 
 
360 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  44.24 
 
 
380 aa  293  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  41.88 
 
 
385 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  43.22 
 
 
399 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  40.79 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  42.34 
 
 
383 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.58 
 
 
385 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  44.05 
 
 
382 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  40.72 
 
 
389 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  41.57 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  41.85 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  40.4 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  42.11 
 
 
394 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  39.8 
 
 
390 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.3 
 
 
405 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.4 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.86 
 
 
400 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.62 
 
 
407 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.24 
 
 
395 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  37.4 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.86 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  38.95 
 
 
367 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  39.1 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  39.66 
 
 
398 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.82 
 
 
433 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  38.5 
 
 
395 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  39.28 
 
 
399 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  37.57 
 
 
403 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  39.01 
 
 
386 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.84 
 
 
387 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  38.16 
 
 
368 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  38.89 
 
 
400 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  39.42 
 
 
389 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.4 
 
 
389 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  37.68 
 
 
360 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  39.88 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.7 
 
 
389 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  39.74 
 
 
388 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.24 
 
 
405 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.53 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.24 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  41.8 
 
 
378 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  34.63 
 
 
395 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.32 
 
 
459 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.37 
 
 
436 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.52 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  39.01 
 
 
413 aa  216  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.94 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.87 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.07 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.67 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.23 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.24 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  37.57 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.42 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.39 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  35.23 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.15 
 
 
435 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  37.4 
 
 
394 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  33.66 
 
 
471 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.04 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.04 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.04 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  34.94 
 
 
381 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  35.31 
 
 
389 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.71 
 
 
382 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.38 
 
 
406 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.83 
 
 
498 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.9 
 
 
464 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  38.16 
 
 
394 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  36.21 
 
 
344 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  38.87 
 
 
382 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.26 
 
 
475 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  38.87 
 
 
382 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  31.86 
 
 
503 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.09 
 
 
381 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  35.68 
 
 
474 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  35.04 
 
 
380 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  33.33 
 
 
386 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.38 
 
 
418 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.33 
 
 
407 aa  206  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  35.17 
 
 
414 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  35.2 
 
 
471 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  35.75 
 
 
383 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  34.15 
 
 
401 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.01 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  35.77 
 
 
451 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  35.77 
 
 
451 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.11 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.83 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  36.07 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.32 
 
 
386 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.65 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>