187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0015 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0015  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  100 
 
 
540 aa  1093    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.45 
 
 
1311 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  27.78 
 
 
1506 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  30.6 
 
 
1577 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  27.99 
 
 
1591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.24 
 
 
731 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.1 
 
 
1577 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.94 
 
 
1512 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  29.06 
 
 
1652 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  26.15 
 
 
870 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  24.95 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  24.91 
 
 
529 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  24.91 
 
 
529 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.87 
 
 
1525 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  24.72 
 
 
529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  24.72 
 
 
529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  24.54 
 
 
529 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  24.72 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  24.58 
 
 
529 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.67 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  24.2 
 
 
529 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.02 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  23.92 
 
 
529 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  23.73 
 
 
529 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  23.92 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  23.73 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  23.73 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  23.92 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  23.73 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  25.98 
 
 
597 aa  110  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.54 
 
 
529 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  23.73 
 
 
529 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  23.35 
 
 
529 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  25 
 
 
826 aa  107  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  24.84 
 
 
750 aa  106  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.92 
 
 
509 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.26 
 
 
530 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  23.91 
 
 
580 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  26.06 
 
 
555 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  25 
 
 
602 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  25.7 
 
 
611 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.32 
 
 
722 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  25.09 
 
 
655 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  25.71 
 
 
607 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  25.79 
 
 
558 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.97 
 
 
567 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.07 
 
 
567 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  25.24 
 
 
559 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  25.4 
 
 
765 aa  87.8  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  23.13 
 
 
560 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  23.54 
 
 
690 aa  87.4  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  25.57 
 
 
580 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  24.95 
 
 
585 aa  87  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  23.61 
 
 
569 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  22.88 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  29.26 
 
 
578 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.19 
 
 
557 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  24.51 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.05 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.66 
 
 
560 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.42 
 
 
1215 aa  84  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.32 
 
 
1202 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  24.44 
 
 
575 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  28.12 
 
 
560 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.38 
 
 
1284 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.73 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.66 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
659 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  23.58 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  24.23 
 
 
571 aa  77  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  22.3 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.81 
 
 
627 aa  70.5  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.14 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.17 
 
 
1181 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.17 
 
 
1175 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.05 
 
 
657 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1174  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
645 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00165263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  30.2 
 
 
752 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.54 
 
 
571 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.05 
 
 
587 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  23.16 
 
 
583 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.13 
 
 
508 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.13 
 
 
508 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.16 
 
 
516 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  21.58 
 
 
520 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  30.6 
 
 
638 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  29.95 
 
 
808 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  27.31 
 
 
583 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.02 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.87 
 
 
601 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1926  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.12 
 
 
568 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  22.4 
 
 
575 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
313 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.26 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4692  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  23.74 
 
 
647 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04085  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  22.79 
 
 
647 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3793  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  22.79 
 
 
647 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377475  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04048  hypothetical protein  22.79 
 
 
647 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.897161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2311  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.71 
 
 
572 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.85 
 
 
605 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>