More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3508 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  100 
 
 		 729 aa  1479    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 864 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.21 
 
 		 735 aa  363  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 879 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 		 1433 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.97 
 
 		 772 aa  340  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 880 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  37.34 
 
 		 589 aa  338  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  45.93 
 
 		 982 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 		 765 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.81 
 
 		 873 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 846 aa  330  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  45.6 
 
 		 786 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 		 876 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 863 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.35 
 
 		 895 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.56 
 
 		 877 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  45.91 
 
 		 900 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 785 aa  320  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 		 817 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.11 
 
 		 659 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 882 aa  316  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 1350 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.21 
 
 		 631 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.47 
 
 		 874 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.18 
 
 		 661 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.03 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 736 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 902 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 		 756 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 		 1791 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  41.31 
 
 		 755 aa  307  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 724 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 631 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  42.82 
 
 		 1560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  44.01 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  43.04 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 690 aa  304  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 		 1124 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 1003 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 718 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 1127 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1452 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.93 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 1075 aa  301  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 916 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 869 aa  300  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 822 aa  300  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.69 
 
 		 866 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 1596 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 595 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  45.12 
 
 		 571 aa  297  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 731 aa  297  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 633 aa  297  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.98 
 
 		 651 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.06 
 
 		 763 aa  296  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1691 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.22 
 
 		 1023 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 764 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 946 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  41.18 
 
 		 641 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 969 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 827 aa  295  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  42.39 
 
 		 651 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 		 1195 aa  294  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  43.75 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  42.49 
 
 		 666 aa  294  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 		 1110 aa  294  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.82 
 
 		 655 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  43.96 
 
 		 559 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 		 1199 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 781 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 907 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 		 524 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  44.11 
 
 		 1125 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.71 
 
 		 645 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.18 
 
 		 965 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1027 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 643 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  40.74 
 
 		 803 aa  291  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  45.43 
 
 		 737 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 903 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1135 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 1066 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.56 
 
 		 853 aa  290  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 1204 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 		 643 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 812 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 973 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  42.32 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1070 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 957 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.22 
 
 		 751 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 932 aa  289  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 		 873 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>