77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1040 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1246    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  52.84 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  28.15 
 
 		 1276 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  26.05 
 
 		 1141 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  30.14 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  30.34 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  28.13 
 
 		 891 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.43 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  29.45 
 
 		 554 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.79 
 
 		 803 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  30.82 
 
 		 801 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 437 aa  94  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.06 
 
 		 562 aa  87  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  25.38 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.43 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.42 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  25 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.21 
 
 		 564 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  27.06 
 
 		 444 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.17 
 
 		 873 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  25.24 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.47 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  26.37 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.62 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.62 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.34 
 
 		 654 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1086 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.9 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.1 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.98 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.1 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  28.18 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.81 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  24.08 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  27.02 
 
 		 727 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  21.05 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  24.09 
 
 		 508 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  28.04 
 
 		 864 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  21.05 
 
 		 597 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.37 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.37 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  22.7 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 1025 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.37 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.48 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  20.42 
 
 		 482 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  26.09 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  26.98 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.6 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  24.24 
 
 		 434 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  21.47 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  27.39 
 
 		 388 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  27.9 
 
 		 576 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  26.59 
 
 		 457 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 680 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.68 
 
 		 699 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.37 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  24.32 
 
 		 372 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  20.24 
 
 		 450 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  19.94 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 685 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  24.87 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.49 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 679 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  24.89 
 
 		 305 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 684 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  22.98 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.9 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  25.9 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.89 
 
 		 544 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.15 
 
 		 387 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>