More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3850 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  100 
 
 		 318 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  81.65 
 
 		 321 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  81.65 
 
 		 321 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  64.69 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  60.44 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  60.13 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  60.95 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  60.76 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  61.13 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  60.95 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  59.12 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  59.49 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  61.59 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  58.31 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04593  transaldolase B  59.18 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  59.44 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  58.31 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  57.86 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  60.66 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  58.36 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  58.1 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  58.68 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  58.73 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  57.73 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  57.55 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  57.28 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  57.5 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  58.18 
 
 		 310 aa  358  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  57.37 
 
 		 316 aa  358  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  57.57 
 
 		 320 aa  358  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  58.96 
 
 		 321 aa  358  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  55.38 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  57.01 
 
 		 318 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  55.84 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  55.52 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  55.52 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  55.52 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  57.5 
 
 		 313 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  56.52 
 
 		 317 aa  351  8.999999999999999e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  56.01 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  54.86 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  58.23 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  55.7 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  57.99 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2361  transaldolase B  56.83 
 
 		 307 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.05 
 
 		 387 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.05 
 
 		 387 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  55.7 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  57.28 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  54.26 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  55.06 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  55.66 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  54.09 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1357  transaldolase B  54.57 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  55.21 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  58.54 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  55.24 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  55.24 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  54.92 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  54.92 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  54.92 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  53.94 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  51.89 
 
 		 316 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  54.89 
 
 		 338 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0685  transaldolase B  55.41 
 
 		 318 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230233  normal  0.397799 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  54.89 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  54.89 
 
 		 338 aa  335  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  53.94 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  52.06 
 
 		 316 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  53.94 
 
 		 317 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  54.89 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  54.43 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  54.66 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  54.43 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  54.43 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  54.66 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  54.66 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  54.43 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  54.57 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  54.57 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  53.92 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  54.57 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  54.57 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  54.57 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  53.85 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  54.23 
 
 		 318 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  53.92 
 
 		 389 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  52.83 
 
 		 316 aa  331  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>