More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0685 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0685  transaldolase B  100 
 
 		 318 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230233  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04593  transaldolase B  79.56 
 
 		 322 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  57.32 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  57.32 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  55.41 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  55.13 
 
 		 324 aa  331  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  51.74 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  51.11 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  54.26 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  51.29 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  51.27 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  49.68 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  51.29 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  50.48 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  49.36 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  49.52 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  49.68 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  50.65 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  48.73 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  49.36 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  49.36 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  49.2 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  48.41 
 
 		 320 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  49.04 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  47.77 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  49.21 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  49.04 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  50.79 
 
 		 310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  49.84 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  49.84 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  49.52 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  49.84 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  49.84 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  49.52 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  49.52 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  47.77 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  47.77 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  49.52 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  299  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  49.52 
 
 		 317 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  48.71 
 
 		 317 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  50.32 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  48.09 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  47.77 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  48.71 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  48.58 
 
 		 316 aa  297  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  48.09 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  48.09 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  48.09 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  49.36 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  50.65 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  50.16 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  48.4 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  48.58 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  51.63 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  48.87 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  47.13 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  47.13 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  47.95 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  50 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  46.5 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  50.16 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  49.69 
 
 		 334 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  49.84 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0645  transaldolase B  50.95 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  48.74 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  46.2 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1357  transaldolase B  49.37 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  49.38 
 
 		 389 aa  287  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  48.53 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  52.75 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  48.59 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  48.9 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  48.1 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  47.94 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  52.06 
 
 		 308 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  47.62 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  47.62 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2361  transaldolase B  51.63 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  47.62 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  46.03 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  48.56 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  47.62 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  46.88 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  49.35 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  49.51 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  48.74 
 
 		 387 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>