251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3640 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  100 
 
 
434 aa  851    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  57.48 
 
 
428 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  50 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.85 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.11 
 
 
607 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  49.6 
 
 
399 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  47.03 
 
 
399 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  44.08 
 
 
400 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  44.75 
 
 
406 aa  318  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  42.72 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.35 
 
 
438 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.12 
 
 
438 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  44.5 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  42.46 
 
 
414 aa  299  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  40.09 
 
 
474 aa  286  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  40.32 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  38.22 
 
 
361 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.68 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  36.8 
 
 
366 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  32.53 
 
 
401 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
345 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  35.93 
 
 
339 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 
504 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  36.73 
 
 
304 aa  97.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  33.33 
 
 
294 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.05 
 
 
517 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  34.46 
 
 
305 aa  93.2  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  33.78 
 
 
305 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  36.22 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  29.9 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  34.78 
 
 
304 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  34.78 
 
 
304 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  36.05 
 
 
298 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
496 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.11 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.63 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.1 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  35.5 
 
 
641 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 
467 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 
509 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  27.15 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.21 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 
400 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 
490 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.34 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  26.25 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.86 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  26.88 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 
368 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
510 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.85 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  26.42 
 
 
353 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.99 
 
 
509 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 
287 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  28.95 
 
 
335 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  25.29 
 
 
364 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 
453 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  24.56 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
487 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.96 
 
 
400 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.7 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 
475 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  23.15 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  36.63 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  23.79 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25.58 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.47 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  25.53 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  27.07 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  25.86 
 
 
323 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  25.43 
 
 
337 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 
621 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  26.23 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 
424 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  23.72 
 
 
427 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  27.92 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  27.92 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  26.03 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.92 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  30.6 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  27.92 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  29.43 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.92 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>