110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0066 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 
294 aa  215  6e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 
297 aa  198  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  36.2 
 
 
291 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  35.02 
 
 
292 aa  172  8e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  33.45 
 
 
291 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  35.71 
 
 
293 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  32.62 
 
 
293 aa  167  3e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  35.87 
 
 
292 aa  164  1e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  31.27 
 
 
308 aa  164  2e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  37.56 
 
 
293 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
296 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 
292 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 
293 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  33.09 
 
 
292 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
293 aa  148  1e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
298 aa  147  2e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 
294 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 
293 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 
296 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
309 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 
338 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  29.2 
 
 
294 aa  142  1e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
295 aa  141  1e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
295 aa  141  1e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 
311 aa  140  2e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  32.83 
 
 
293 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 
295 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
289 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
295 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  27.74 
 
 
293 aa  135  7e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.94 
 
 
291 aa  134  2e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 
292 aa  134  2e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.41532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  27.78 
 
 
293 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
293 aa  133  4e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.44866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
293 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.89266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 
291 aa  132  7e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  28.67 
 
 
296 aa  130  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
292 aa  129  4e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 
291 aa  130  4e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.44406e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
293 aa  128  9e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
297 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
295 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 
300 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  32.76 
 
 
321 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  29.43 
 
 
298 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 
292 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 
295 aa  120  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
293 aa  117  2e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  33.88 
 
 
300 aa  117  2e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  26.98 
 
 
332 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.18 
 
 
257 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
377 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 
380 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
373 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 
399 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  26.35 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
386 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
390 aa  84.3  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
409 aa  70.5  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
402 aa  65.5  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
705 aa  56.2  6e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 
474 aa  54.7  2e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  26.72 
 
 
476 aa  54.3  3e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 
476 aa  52.8  6e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.86011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 
317 aa  52.4  8e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 
531 aa  51.2  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 
488 aa  51.2  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
716 aa  50.4  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.76 
 
 
478 aa  50.4  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 
476 aa  50.4  3e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.93045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.87 
 
 
475 aa  49.3  8e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 
486 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  23.46 
 
 
475 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.37144e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.5 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.8537e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.81 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  24 
 
 
618 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.96 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
317 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
489 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
600 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  26.71 
 
 
501 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  21.09 
 
 
532 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.5 
 
 
473 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 
506 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
590 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  23.39 
 
 
502 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.62793e-07  hitchhiker  1.42762e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.89 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 
503 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  21.09 
 
 
529 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.23 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.66 
 
 
514 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 
527 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  20.64 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 
501 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 
506 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 
506 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>