More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1995 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1995  pseudouridine synthase  100 
 
 
241 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2080  pseudouridine synthase  96.68 
 
 
241 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1865  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  92.5 
 
 
241 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1974  pseudouridine synthase  71.11 
 
 
238 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  44.78 
 
 
235 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.74 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1202  pseudouridine synthase  37.4 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.0231079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  42.62 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  46.35 
 
 
316 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  39.75 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  41.81 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  39.62 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  43.03 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  41.11 
 
 
345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  40.08 
 
 
346 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.99 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  39.34 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  41.92 
 
 
362 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  41 
 
 
331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  40.5 
 
 
378 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  36.14 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  38.11 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.17 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  39.92 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  37.7 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.87 
 
 
349 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  41.88 
 
 
399 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.78 
 
 
319 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  38.78 
 
 
310 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.52 
 
 
332 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.1 
 
 
314 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.59 
 
 
334 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  46.15 
 
 
301 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  40.08 
 
 
352 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  40.08 
 
 
346 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  40.68 
 
 
322 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  39 
 
 
398 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 
313 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.33 
 
 
395 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.33 
 
 
395 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  39.33 
 
 
395 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  39.92 
 
 
343 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  39.33 
 
 
389 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  39.33 
 
 
389 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  39.33 
 
 
389 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  39.33 
 
 
389 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0494  pseudouridine synthase  38.76 
 
 
268 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  41.48 
 
 
334 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  45.73 
 
 
302 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  48.67 
 
 
298 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.22 
 
 
337 aa  121  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  37.82 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3699  pseudouridine synthase, RluA family  33.6 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  39.53 
 
 
343 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3012  RluA family pseudouridine synthase  40.96 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17598  normal  0.601739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  35.34 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
407 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.79 
 
 
315 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.5 
 
 
402 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  40.25 
 
 
338 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  37.5 
 
 
402 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
402 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.39 
 
 
343 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  39.47 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.92 
 
 
438 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  35.98 
 
 
376 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  32.35 
 
 
303 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.88 
 
 
320 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  40.25 
 
 
315 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  38.24 
 
 
351 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  38.46 
 
 
436 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  36.09 
 
 
377 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  36.68 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  36.67 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.99 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  37.25 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  34.69 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  34.14 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.93 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  39.27 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  37.08 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.6 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0921  RluA family pseudouridine synthase  36.8 
 
 
318 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  38.6 
 
 
225 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  41.1 
 
 
370 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  39.66 
 
 
313 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1592  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.44 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  36.13 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  37.65 
 
 
324 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2219  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.6 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.654666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1873  pseudouridine synthase, RluA family  41.6 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0755786  normal  0.858498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4330  pseudouridine synthase  40.09 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0697869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  37.02 
 
 
302 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2576  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.74 
 
 
244 aa  115  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.8 
 
 
310 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0921  pseudouridine synthase, RluA family  35.27 
 
 
344 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  33.05 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  37.94 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  39.45 
 
 
541 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>