More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0927 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  100 
 
 		 425 aa  870    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  63.76 
 
 		 420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  58.29 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  58.87 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  57.82 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  57.92 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  58.05 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  54.12 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  41.63 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  39.13 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  39.23 
 
 		 405 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  40.19 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  40.55 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  39.09 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.81 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  36.24 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  35.19 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  35.19 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  34.95 
 
 		 409 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  34.8 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.37 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  34.38 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  31.32 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  34.81 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  33.09 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  30.43 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  31.86 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  31.12 
 
 		 515 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.69 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  29.69 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  32.23 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  30.51 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  28.07 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  32.89 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  30.27 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  31.33 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  30.83 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.73 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  34.64 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.75 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  29.87 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.88 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  30.02 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  29.06 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  29.68 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  28.98 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.32 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.7 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.38 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.4 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.02 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  29.23 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  27.8 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  31.62 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  27.95 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.87 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  32.36 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  29.58 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  29.9 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.83 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.08 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  29.71 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  28.24 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.54 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  29.97 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  29.88 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  29.74 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  31.31 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  28.98 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.56 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  29.38 
 
 		 423 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  26.68 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  29.04 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.54 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  27.44 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.17 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  29.61 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.49 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  33.61 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>