More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1725 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  100 
 
 
553 aa  1110    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  55.96 
 
 
561 aa  628  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  55.07 
 
 
553 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  50.63 
 
 
871 aa  551  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  52.38 
 
 
564 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  49.29 
 
 
558 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  50.18 
 
 
558 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  47 
 
 
564 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  48.16 
 
 
573 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  46.15 
 
 
787 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  50.27 
 
 
553 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  48.3 
 
 
553 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  48.6 
 
 
571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  49.91 
 
 
554 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  47.65 
 
 
561 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.36 
 
 
568 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  46.42 
 
 
558 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.03 
 
 
568 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  49.1 
 
 
561 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
568 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  51.18 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  45.94 
 
 
570 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  48.03 
 
 
568 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.43 
 
 
568 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.03 
 
 
568 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  45.54 
 
 
566 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.49 
 
 
563 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.68 
 
 
571 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  45.92 
 
 
567 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.49 
 
 
568 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  45.28 
 
 
573 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.36 
 
 
568 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.43 
 
 
568 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.25 
 
 
568 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  45.47 
 
 
562 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  45.33 
 
 
563 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  45.76 
 
 
571 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.1 
 
 
568 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  45.55 
 
 
557 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  45.28 
 
 
557 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  44.22 
 
 
565 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  46.61 
 
 
568 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  45.99 
 
 
556 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  43.9 
 
 
570 aa  475  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  46.32 
 
 
561 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  47.94 
 
 
559 aa  477  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.77 
 
 
599 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  44.84 
 
 
577 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.95 
 
 
599 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.5 
 
 
575 aa  475  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  47.68 
 
 
578 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.23 
 
 
603 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  45.85 
 
 
610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.6 
 
 
599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  46.2 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  45.47 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  47.1 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.54 
 
 
885 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  48.79 
 
 
520 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  49.39 
 
 
521 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
577 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.15 
 
 
571 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  47.47 
 
 
520 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.05 
 
 
891 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  43.53 
 
 
569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  49.27 
 
 
514 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  44.37 
 
 
888 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  47.88 
 
 
527 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.03 
 
 
514 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
591 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  49.02 
 
 
570 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  40.93 
 
 
561 aa  445  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  45 
 
 
585 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  43.49 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 
520 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 
520 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  52.72 
 
 
520 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  47.89 
 
 
514 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  42.48 
 
 
565 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  44.7 
 
 
580 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  42.35 
 
 
568 aa  435  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.98 
 
 
552 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  45.38 
 
 
778 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.31 
 
 
549 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
589 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  49.36 
 
 
497 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1163  type II secretion system protein E  45.59 
 
 
782 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  50.84 
 
 
500 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  43.74 
 
 
575 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  45.79 
 
 
778 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  49.14 
 
 
497 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  46.44 
 
 
489 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  47.67 
 
 
520 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  54.78 
 
 
502 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  44.8 
 
 
523 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  54.83 
 
 
497 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  54.78 
 
 
502 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.72 
 
 
501 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>