More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0138 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 441 aa  904    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  30.89 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  33.85 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  30.73 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 		 438 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  32.32 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  31.1 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  30.98 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.04 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  28.34 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  31.8 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  30.98 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  27.9 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  30.13 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  31.33 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.24 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  27.95 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  30 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  28.17 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  27.61 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.36 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.99 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.16 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.96 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  31 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  28.17 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.57 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.57 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.57 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.45 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  29.65 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.47 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.18 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  28.35 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.35 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  29.65 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.35 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.35 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.72 
 
 		 455 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  30.74 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  29.84 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  28.14 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.32 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  29.26 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  28.35 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.72 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  24.88 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.98 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.06 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1755  (Uracil-5)-methyltransferase  29.42 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.38216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.93 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0451  (Uracil-5)-methyltransferase  27.11 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.222179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  28.99 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.28 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  26.93 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  23.83 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.66 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  28.11 
 
 		 458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.07 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.29 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.45 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.24 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  28.03 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3163  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.98 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0558904  normal  0.0471726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  27.25 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  29.19 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3277  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.07 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  normal  0.0635589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  28.8 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.18 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.11 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3179  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.75 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0330224  normal  0.448815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.11 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  27.15 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  28.89 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.31 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.89 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  25.33 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  28.67 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  28.67 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  27.54 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  27.54 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.89 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  29.03 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  29.05 
 
 		 488 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.27 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>