233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3876 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
348 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  82.07 
 
 
357 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.15 
 
 
341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  53.02 
 
 
320 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  53.4 
 
 
320 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  44.09 
 
 
342 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  42.86 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  42.32 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.54 
 
 
331 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  42.55 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  42.55 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  42.55 
 
 
359 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  49.19 
 
 
314 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.39 
 
 
331 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 
328 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.38 
 
 
321 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  41.37 
 
 
295 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  33.64 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  35.4 
 
 
351 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  36.45 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  37.33 
 
 
322 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  33.88 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  37.8 
 
 
310 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.59 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.67 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.33 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  28.67 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  26.2 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  24.09 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.25 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  24.38 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.43 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  24.38 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.59 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  25.38 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
530 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  25.38 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  25.38 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  36.04 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.17 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.5 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  36.04 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.35 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  25.28 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  25.15 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.67 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  27.8 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.74 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.1 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.73 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.34 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.86 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.63 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 
520 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  25.29 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  24.8 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  27.37 
 
 
299 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.22 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  23.53 
 
 
327 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.06 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
296 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  26.02 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  25 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.37 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.12 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  35.43 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  24.64 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  21.55 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.29 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.07 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  30.43 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  24.08 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.56 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  24.4 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  29.87 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>