More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3810 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.41 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  38.02 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  30.04 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  38.02 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  34.72 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  34.72 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  29.17 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.38 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  32.11 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  28.09 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.94 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.16 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 425 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  26.67 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  30.21 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.58 
 
 		 394 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  29.88 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  33 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.22 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.55 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  25.91 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.09 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.09 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.09 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.09 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>