More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1914 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  100 
 
 
409 aa  826    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  61.7 
 
 
394 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  51.87 
 
 
383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  50.67 
 
 
383 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  49.87 
 
 
383 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.31 
 
 
405 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  38.4 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  38.4 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  36.14 
 
 
385 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  31.7 
 
 
409 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  38.1 
 
 
382 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  33.07 
 
 
413 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.33 
 
 
394 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  32.33 
 
 
374 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  32.88 
 
 
374 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  32.98 
 
 
408 aa  186  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  33.42 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  38.22 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  37.96 
 
 
382 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  33.95 
 
 
410 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  37.96 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  33.59 
 
 
391 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.96 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  33.78 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.33 
 
 
358 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.97 
 
 
376 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.33 
 
 
358 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  33.76 
 
 
376 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  33.96 
 
 
376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  34.6 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  33.87 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  36.77 
 
 
387 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  35.7 
 
 
377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  36.27 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  34.99 
 
 
376 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  34.39 
 
 
378 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  32.57 
 
 
388 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  36.1 
 
 
388 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.61 
 
 
415 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  33.95 
 
 
376 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.54 
 
 
372 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  33.96 
 
 
376 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.55 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  35.94 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  33.13 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.57 
 
 
407 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  32.51 
 
 
376 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  30.2 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  37.62 
 
 
381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  33.02 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  35.14 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.96 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  28.34 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  38.28 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  30.6 
 
 
372 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  32.51 
 
 
372 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  29.03 
 
 
438 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  30.08 
 
 
436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.17 
 
 
436 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.01 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  37.77 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  36.7 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.79 
 
 
375 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.4 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.05 
 
 
376 aa  126  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  32.56 
 
 
418 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  28.64 
 
 
424 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  27.85 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.55 
 
 
405 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.07 
 
 
423 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.82 
 
 
418 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  31.54 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  26.6 
 
 
428 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  32.6 
 
 
402 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  31.1 
 
 
401 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  26.36 
 
 
422 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.69 
 
 
432 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  28.74 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  28.5 
 
 
368 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  32.48 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.91 
 
 
424 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.8 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.03 
 
 
402 aa  86.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  27.58 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  27.34 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.2 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.73 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  25 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  25.65 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.9 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  26.2 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  26.39 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.42 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  24.67 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  24.87 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  29.47 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>