More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0009 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0009  helix-turn-helix- domain containing protein  100 
 
 
315 aa  649  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3826  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 
307 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.753921  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5642  transcriptional regulator, AraC family  35.5 
 
 
308 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3823  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 
309 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  33.01 
 
 
279 aa  71.2  2e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 
293 aa  66.2  7e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
332 aa  63.5  4e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 
440 aa  63.2  5e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 
303 aa  61.6  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 
289 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 
296 aa  61.6  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 
293 aa  61.2  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 
296 aa  60.8  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 
286 aa  60.1  4e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
356 aa  60.1  4e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 
326 aa  60.5  4e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 
289 aa  58.5  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  32.32 
 
 
507 aa  58.5  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.97 
 
 
294 aa  58.9  1e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 
300 aa  57.8  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
289 aa  58.2  2e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 
298 aa  58.2  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 
316 aa  58.2  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 
359 aa  57.8  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 
316 aa  57.8  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
284 aa  57.4  3e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.85 
 
 
314 aa  57.8  3e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 
287 aa  57  4e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 
299 aa  57  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  28 
 
 
529 aa  57  4e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
336 aa  56.6  5e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  31.31 
 
 
507 aa  56.6  5e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
519 aa  57  5e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  27.83 
 
 
529 aa  56.6  5e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 
293 aa  56.2  6e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.13 
 
 
305 aa  56.2  6e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
327 aa  56.2  8e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 
310 aa  55.8  8e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
299 aa  55.8  9e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
320 aa  55.8  9e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 
351 aa  55.8  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
296 aa  55.8  9e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 
250 aa  55.5  1e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
307 aa  55.1  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.54 
 
 
310 aa  55.8  1e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  30.09 
 
 
331 aa  55.1  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
324 aa  55.5  1e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.54 
 
 
310 aa  55.5  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
342 aa  55.5  1e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.54 
 
 
310 aa  55.5  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 
305 aa  54.3  2e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
294 aa  55.1  2e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 
305 aa  54.3  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.19 
 
 
310 aa  54.7  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  22.16 
 
 
331 aa  54.7  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 
305 aa  55.1  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
322 aa  54.7  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.19 
 
 
310 aa  55.1  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 
346 aa  55.1  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 
273 aa  54.3  3e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.77 
 
 
280 aa  54.3  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 
313 aa  54.3  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
793 aa  53.9  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
317 aa  53.9  3e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
289 aa  53.5  4e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  25.26 
 
 
160 aa  53.5  4e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 
296 aa  53.5  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 
311 aa  53.9  4e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
296 aa  53.9  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  31.58 
 
 
304 aa  53.9  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
296 aa  53.9  4e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 
296 aa  53.5  5e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 
293 aa  53.1  5e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
296 aa  53.1  5e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2988  transcriptional regulator  28.87 
 
 
314 aa  53.5  5e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.3 
 
 
316 aa  53.1  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
299 aa  53.5  5e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  28.85 
 
 
340 aa  53.1  5e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
304 aa  53.1  6e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.18 
 
 
331 aa  53.1  6e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
287 aa  53.1  6e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
296 aa  53.1  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
332 aa  53.1  6e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
530 aa  53.1  6e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 
311 aa  53.1  6e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  23.49 
 
 
327 aa  52.8  7e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25 
 
 
281 aa  52.8  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25 
 
 
281 aa  52.8  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25 
 
 
281 aa  52.8  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25 
 
 
281 aa  52.8  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  33.94 
 
 
211 aa  52.8  9e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
311 aa  52.8  9e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 
297 aa  52.4  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  1.5359e-05  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
296 aa  52.4  9e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.12725e-06 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
317 aa  52.8  9e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>