211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16461 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  82.57 
 
 		 413 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  100 
 
 		 413 aa  814    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  85.47 
 
 		 413 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  63.68 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  38.48 
 
 		 440 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.47 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  37.82 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  32.27 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  28.47 
 
 		 420 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.44 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  28.21 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.41 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.85 
 
 		 566 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  27.46 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.01 
 
 		 479 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.45 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.75 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.09 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 462 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.26 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.78 
 
 		 457 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.58 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.58 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.8 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  26.22 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.32 
 
 		 517 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.96 
 
 		 517 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.86 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  22.7 
 
 		 529 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  21.25 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.06 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  23.64 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  20.59 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.24 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  21.28 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  20.64 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  21.49 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  20.81 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.45 
 
 		 529 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.45 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  27.21 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  20.53 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  22.85 
 
 		 545 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  29.3 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  25.69 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  17.84 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  33.81 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.99 
 
 		 637 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.04 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  23.03 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  29.13 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.5 
 
 		 548 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  30.56 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  30 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  27.87 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  26.78 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  24.57 
 
 		 650 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  30.56 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  30.48 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  30.56 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  26.07 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  33.59 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  23.01 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  27.34 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  33.59 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  33.59 
 
 		 452 aa  50.4  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  20.87 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  28.12 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.08 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  26.24 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.79 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  26.24 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  33.59 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  21.41 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  20.19 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  29.53 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  32.82 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  29.85 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  29.53 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  29.1 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  28 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  30.46 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  32.88 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>