More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3000 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  100 
 
 
472 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  78.01 
 
 
476 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  73.04 
 
 
463 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  70.84 
 
 
463 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  71.53 
 
 
493 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  66.37 
 
 
531 aa  614  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  67.65 
 
 
516 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  68.28 
 
 
478 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  65.42 
 
 
471 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  67.9 
 
 
515 aa  609  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  64.26 
 
 
516 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  68.23 
 
 
461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  67.9 
 
 
482 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  65.16 
 
 
725 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  66.06 
 
 
462 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  65.9 
 
 
527 aa  591  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  64.91 
 
 
490 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  65.24 
 
 
478 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  67.44 
 
 
755 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  67.88 
 
 
496 aa  581  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  63.03 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  62.18 
 
 
470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  61.59 
 
 
479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  64.62 
 
 
471 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  61.57 
 
 
483 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  64.15 
 
 
467 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  64.62 
 
 
471 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  64.62 
 
 
471 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  67.52 
 
 
512 aa  568  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  64.85 
 
 
487 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  60.67 
 
 
447 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  63.64 
 
 
465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  65.53 
 
 
495 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  63.17 
 
 
463 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1930  GTP-binding protein EngA  65.19 
 
 
467 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322711  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  58.2 
 
 
709 aa  543  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  56.39 
 
 
734 aa  522  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  60.88 
 
 
458 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  45.74 
 
 
455 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.96 
 
 
441 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  43.18 
 
 
449 aa  355  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  42.79 
 
 
444 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 
456 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  40.92 
 
 
436 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 
456 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  41.19 
 
 
436 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  44.07 
 
 
455 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  42.53 
 
 
453 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  40.96 
 
 
436 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 
438 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 
438 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
440 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  41.29 
 
 
453 aa  348  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  42.33 
 
 
439 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  41.89 
 
 
438 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  43.5 
 
 
461 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  41.65 
 
 
436 aa  347  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
456 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  41.15 
 
 
436 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  42.25 
 
 
452 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  42.76 
 
 
438 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.82 
 
 
438 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 
436 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  41.5 
 
 
493 aa  342  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  40.5 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  40.92 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  42.79 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  38.53 
 
 
436 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  40.81 
 
 
457 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  38.53 
 
 
436 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  41.52 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  41.12 
 
 
440 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  40.32 
 
 
441 aa  339  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  41.72 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  41.57 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  40.46 
 
 
436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  43.81 
 
 
434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  41.29 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  39.55 
 
 
441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 
457 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
457 aa  336  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  39.09 
 
 
440 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 
441 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  39.46 
 
 
440 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 
440 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  41.95 
 
 
441 aa  332  6e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  39.32 
 
 
442 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  38.76 
 
 
441 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  39.82 
 
 
437 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  42.21 
 
 
453 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  41.61 
 
 
452 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>