248 genes were found for organism Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ava_C0001  CDS  NC_007412  399  1703  1305  major facilitator transporter  YP_320279  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0002  CDS  NC_007412  1718  10321  8604  amino acid adenylation  YP_320280  normal  normal  0.0171576  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0003  CDS  NC_007412  10345  11169  825  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_320281  normal  normal  0.0103837  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0004  CDS  NC_007412  11297  12241  945  phosphopantetheine-binding  YP_320282  normal  normal  0.0557095  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0005  CDS  NC_007412  12368  14536  2169  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_320283  normal  normal  0.06711  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0006  CDS  NC_007412  14595  15410  816  hypothetical protein  YP_320284  normal  0.868865  normal  0.0557095  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0007  CDS  NC_007412  15453  17849  2397  condensation domain-containing protein  YP_320285  normal  0.441594  normal  0.0181415  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0008  CDS  NC_007412  17852  18292  441  phosphopantetheine-binding  YP_320286  normal  0.215439  normal  0.0104509  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0009  CDS  NC_007412  18349  26724  8376  amino acid adenylation  YP_320287  normal  normal  0.0712365  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0010  CDS  NC_007412  27512  30106  2595  TonB-dependent siderophore receptor  YP_320288  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0011  CDS  NC_007412  30108  31712  1605  extracellular solute-binding protein  YP_320289  normal  normal  0.0146567  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0012  CDS  NC_007412  31828  32730  903  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_320290  normal  0.465454  normal  0.0116121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0013  CDS  NC_007412  32727  33605  879  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_320291  normal  0.943696  normal  0.0118376  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0014  CDS  NC_007412  33733  34662  930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  YP_320292  normal  0.709521  normal  0.0140124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0015  CDS  NC_007412  34649  35266  618  ABC transporter-like  YP_320293  normal  0.794177  normal  0.0136608  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0016  CDS  NC_007412  35898  36065  168  hypothetical protein  YP_320294  normal  0.244566  normal  0.0116121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0017  CDS  NC_007412  36162  36764  603  hypothetical protein  YP_320295  normal  0.346176  normal  0.0133176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0018  CDS  NC_007412  37195  37644  450  hypothetical protein  YP_320296  normal  0.606438  normal  0.0122411  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0019  CDS  NC_007412  37828  38196  369  hypothetical protein  YP_320297  normal  0.813688  normal  0.0283821  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0020  CDS  NC_007412  38245  38466  222  hypothetical protein  YP_320298  normal  0.855565  normal  0.0563674  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0021  CDS  NC_007412  38456  38641  186  hypothetical protein  YP_320299  normal  normal  0.0544811  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0022  CDS  NC_007412  38644  39768  1125  IS891/IS1136/IS1341 transposase  YP_320300  normal  normal  0.0682422  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0023  CDS  NC_007412  40106  41812  1707  major outer membrane protein  YP_320301  normal  0.500646  normal  0.0378832  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0024  CDS  NC_007412  41839  42990  1152  major facilitator transporter  YP_320302  normal  normal  0.0151304  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0025  CDS  NC_007412  43044  43667  624  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_320303  normal  normal  0.0121631  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0026  CDS  NC_007412  43760  44899  1140  major facilitator transporter  YP_320304  normal  0.371223  normal  0.0147554  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0027  CDS  NC_007412  45083  45982  900  AraC family transcriptional regulator  YP_320305  normal  0.618912  normal  0.0626425  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0028  CDS  NC_007412  46157  46810  654  transcriptional regulator  YP_320306  normal  0.572077  normal  0.204969  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0029  CDS  NC_007412  46864  47442  579  hypothetical protein  YP_320307  normal  0.931717  normal  0.197929  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0030  CDS  NC_007412  47642  49279  1638  ATPase  YP_320308  normal  normal  0.141323  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0031  CDS  NC_007412  49404  49970  567  hypothetical protein  YP_320309  normal  normal  0.192563  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0032  CDS  NC_007412  50342  50872  531  hypothetical protein  YP_320310  normal  normal  0.487549  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0033  CDS  NC_007412  51340  53223  1884  RNA-directed DNA polymerase  YP_320311  normal  normal  0.590524  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0034  CDS  NC_007412  53523  53858  336  hypothetical protein  YP_320312  normal  normal  0.677727  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0035  CDS  NC_007412  53901  56708  2808  hypothetical protein  YP_320313  normal  normal  0.981613  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0036  CDS  NC_007412  56905  58200  1296  transposase IS605  YP_320314  normal  normal  0.78351  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0037  CDS  NC_007412  58383  59114  732  hypothetical protein  YP_320315  normal  normal  0.755923  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0038  CDS  NC_007412  59185  60336  1152  hypothetical protein  YP_320316  normal  normal  0.818872  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0039  CDS  NC_007412  60378  60743  366  S23 ribosomal  YP_320317  normal  normal  0.746441  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0040  CDS  NC_007412  60778  61554  777  hypothetical protein  YP_320318  normal  normal  0.761617  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0041  CDS  NC_007412  61579  63408  1830  hypothetical protein  YP_320319  normal  0.616991  normal  0.873724  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0042  CDS  NC_007412  63405  64256  852  hypothetical protein  YP_320320  normal  0.144366  normal  0.528183  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0043  CDS  NC_007412  64262  65674  1413  hypothetical protein  YP_320321  normal  0.0397934  normal  0.5668  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0044  CDS  NC_007412  65758  67584  1827  hypothetical protein  YP_320322  normal  0.612223  normal  0.249044  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0045  CDS  NC_007412  67671  70178  2508  hypothetical protein  YP_320323  normal  0.647107  normal  0.26765  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0046  CDS  NC_007412  70477  71310  834  hypothetical protein  YP_320324  normal  normal  0.185589  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0047  CDS  NC_007412  71339  71488  150  hypothetical protein  YP_320325  normal  normal  0.164109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0048  CDS  NC_007412  71562  72980  1419  hypothetical protein  YP_320326  normal  normal  0.217357  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0049  CDS  NC_007412  73009  73851  843  hypothetical protein  YP_320327  normal  normal  0.317193  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0050  CDS  NC_007412  74071  80961  6891  hemolysin-type calcium-binding region  YP_320328  normal  normal  0.133604  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0051  CDS  NC_007412  81444  82154  711  hypothetical protein  YP_320329  normal  0.231649  normal  0.0138382  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0052  CDS  NC_007412  82383  82994  612  abortive infection protein  YP_320330  normal  0.184729  normal  0.225056  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0053  CDS  NC_007412  82997  85249  2253  hypothetical protein  YP_320331  normal  0.0689055  normal  0.180289  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0054  CDS  NC_007412  85263  86204  942  hypothetical protein  YP_320332  normal  0.0137082  normal  0.0686234  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0055  CDS  NC_007412  86197  86862  666  hypothetical protein  YP_320333  normal  0.0240243  normal  0.209522  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0056  CDS  NC_007412  87025  87438  414  hypothetical protein  YP_320334  normal  0.096065  normal  0.32678  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0057  CDS  NC_007412  87474  87716  243  hypothetical protein  YP_320335  normal  0.27972  normal  0.322825  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0058  CDS  NC_007412  87780  88970  1191  tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase  YP_320336  normal  0.193098  normal  0.40195  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0059  CDS  NC_007412  89006  89800  795  hypothetical protein  YP_320337  normal  0.119267  normal  0.341508  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0060  CDS  NC_007412  89895  92615  2721  DEAD/DEAH box helicase-like  YP_320338  normal  0.0763729  normal  0.477512  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0061  CDS  NC_007412  92716  93462  747  hypothetical protein  YP_320339  normal  0.588652  normal  0.324166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0062  CDS  NC_007412  93491  93715  225  hypothetical protein  YP_320340  normal  normal  0.295573  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0063  CDS  NC_007412  93783  94781  999  hypothetical protein  YP_320341  normal  normal  0.325511  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0064  CDS  NC_007412  94784  95266  483  hypothetical protein  YP_320342  normal  normal  0.180432  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0065  CDS  NC_007412  95272  95694  423  hypothetical protein  YP_320343  normal  normal  0.178835  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0066  CDS  NC_007412  95738  96466  729  hypothetical protein  YP_320344  normal  0.894979  normal  0.186496  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0067  CDS  NC_007412  96463  97185  723  hypothetical protein  YP_320345  normal  normal  0.470884  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0068  CDS  NC_007412  97188  97784  597  hypothetical protein  YP_320346  normal  0.533931  normal  0.463974  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0069  CDS  NC_007412  97772  98629  858  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  YP_320347  normal  0.701248  normal  0.470884  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0070  CDS  NC_007412  98674  99357  684  hypothetical protein  YP_320348  normal  0.555105  normal  0.643653  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0071  CDS  NC_007412  99406  100593  1188  IS891/IS1136/IS1341 transposase  YP_320349  normal  normal  0.681722  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0072  CDS  NC_007412  100789  101136  348  hypothetical protein  YP_320350  normal  normal  0.83299  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0073  CDS  NC_007412  101213  102154  942  DNA-methyltransferase-like  YP_320351  normal  normal  0.648628  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0074  CDS  NC_007412  102778  103770  993  hypothetical protein  YP_320352  normal  normal  0.881701  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0075  CDS  NC_007412  103851  105185  1335  DNA polymerase III beta subunit family protein  YP_320353  normal  normal  0.912734  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0076  CDS  NC_007412  105250  106539  1290  ATPase  YP_320354  normal  normal  0.872704  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0077  CDS  NC_007412  106668  106976  309  hypothetical protein  YP_320355  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0078  CDS  NC_007412  106973  107770  798  DNA polymerase I-like  YP_320356  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0079  CDS  NC_007412  107780  108148  369  transposase IS4  YP_320357  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0080  CDS  NC_007412  108190  108573  384  transposase  YP_320358  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0081  CDS  NC_007412  108767  109702  936  DNA polymerase I-like  YP_320359  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0082  CDS  NC_007412  109791  110498  708  hypothetical protein  YP_320360  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0083  CDS  NC_007412  110698  111657  960  DNA polymerase III subunit delta  YP_320361  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0084  CDS  NC_007412  111654  112577  924  DNA polymerase III subunit delta'  YP_320362  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0085  CDS  NC_007412  112670  113341  672  hypothetical protein  YP_320363  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0086  CDS  NC_007412  113690  114193  504  transposase (24)  YP_320364  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0087  CDS  NC_007412  114190  114621  432  transposase family protein  YP_320365  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0088  CDS  NC_007412  114762  115262  501  putative transposase  YP_320366  normal  0.984719  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0089  CDS  NC_007412  115299  115688  390  hypothetical protein  YP_320367  normal  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0090  CDS  NC_007412  115841  116083  243  histone-like DNA-binding protein  YP_320368  normal  0.791914  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0091  CDS  NC_007412  116101  116616  516  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_320369  normal  0.337262  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0092  CDS  NC_007412  116672  117283  612  hypothetical protein  YP_320370  normal  0.175282  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0093  CDS  NC_007412  117280  117744  465  endoribonuclease L-PSP  YP_320371  normal  0.0468551  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0094  CDS  NC_007412  117871  118248  378  hypothetical protein  YP_320372  normal  0.027411  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0095  CDS  NC_007412  118270  118557  288  hypothetical protein  YP_320373  normal  0.0919694  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0096  CDS  NC_007412  118701  119492  792  hypothetical protein  YP_320374  normal  0.122908  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0097  CDS  NC_007412  119646  120032  387  hypothetical protein  YP_320375  normal  0.0458441  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0098  CDS  NC_007412  120164  120904  741  abortive infection protein  YP_320376  normal  0.015853  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0099  CDS  NC_007412  120969  121928  960  abortive infection protein  YP_320377  normal  0.0139608  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_C0100  CDS  NC_007412  121997  122653  657  TetR family transcriptional regulator  YP_320378  normal  0.0488762  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>