34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0078 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  100 
 
 		 265 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  37.89 
 
 		 603 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  30.18 
 
 		 785 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  24.89 
 
 		 800 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  29.21 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  25.45 
 
 		 796 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  24.45 
 
 		 743 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  24.77 
 
 		 793 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  26.2 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  23.11 
 
 		 811 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  25.76 
 
 		 788 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  23.36 
 
 		 744 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  24.14 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  25 
 
 		 735 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01430  DNA polymerase epsilon, catalytic subunit a, putative  25.38 
 
 		 2250 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.47 
 
 		 785 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  30.84 
 
 		 782 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.65 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  33.71 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.47 
 
 		 786 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  43.18 
 
 		 794 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  25 
 
 		 784 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  34.29 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  34.29 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2451  hypothetical protein  31.87 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2829  hypothetical protein  31.87 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66970  DNA-directed DNA polymerase epsilon, catalytic subunit A  38.46 
 
 		 2222 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363259 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  39.58 
 
 		 2207 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_52678  DNA polymerase epsilon catalytic subunit that participates with PCNA in late in S phase DNA replication  36.54 
 
 		 2155 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  33.33 
 
 		 821 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  21.43 
 
 		 783 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  26.67 
 
 		 423 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>