134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5509 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  100 
 
 		 603 aa  1238    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0081  DNA polymerase I-like  41.9 
 
 		 311 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  37.89 
 
 		 265 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  29.45 
 
 		 735 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  28.28 
 
 		 792 aa  150  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  26.35 
 
 		 793 aa  146  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  26.71 
 
 		 796 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  27.91 
 
 		 788 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  27.49 
 
 		 743 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  26.89 
 
 		 800 aa  140  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  27.27 
 
 		 785 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  28.45 
 
 		 744 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  26.04 
 
 		 796 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  27.27 
 
 		 811 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  26.15 
 
 		 745 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  26.92 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  22.86 
 
 		 786 aa  108  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  23.93 
 
 		 783 aa  107  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 785 aa  106  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  23.94 
 
 		 781 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  24.31 
 
 		 811 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 794 aa  90.5  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  23.33 
 
 		 782 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  21.88 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  22.18 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  22.01 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.13 
 
 		 794 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  21.84 
 
 		 783 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  22.01 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  22.01 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.27 
 
 		 818 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  24.24 
 
 		 1070 aa  74.3  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  21.84 
 
 		 783 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  23.45 
 
 		 788 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.6 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.25 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  22.84 
 
 		 789 aa  69.3  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  23.02 
 
 		 790 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  20.77 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  20.77 
 
 		 783 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  21.06 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  24.08 
 
 		 912 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  20.91 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  21.3 
 
 		 780 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  20.77 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  23.89 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  22.62 
 
 		 1087 aa  67.4  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  22.56 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  24.3 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  22.02 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  21.72 
 
 		 1058 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  23.91 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.99 
 
 		 807 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  20.75 
 
 		 783 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  23.74 
 
 		 793 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  23.72 
 
 		 941 aa  65.1  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.68 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.83 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  20.47 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  26.04 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  24.29 
 
 		 791 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  22.85 
 
 		 818 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 787 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  21.89 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.98 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  26.26 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  22.14 
 
 		 799 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  23.24 
 
 		 790 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  20.64 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  23.91 
 
 		 816 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  23.99 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  22.46 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.09 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  24.37 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 854 aa  58.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0068  hypothetical protein  36.26 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  21.01 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 787 aa  57.4  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  21.6 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  22.66 
 
 		 786 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  21.78 
 
 		 793 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  23.43 
 
 		 788 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  26.24 
 
 		 853 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  23.86 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.93 
 
 		 788 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  22.11 
 
 		 794 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  22.11 
 
 		 794 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  21.95 
 
 		 552 aa  54.7  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  22.49 
 
 		 792 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  25.27 
 
 		 853 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>