141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1210 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  100 
 
 		 723 aa  1447    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  30.32 
 
 		 716 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  27.91 
 
 		 679 aa  244  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  29.86 
 
 		 768 aa  237  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  27.96 
 
 		 657 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  27.88 
 
 		 655 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  33.43 
 
 		 552 aa  180  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  30.29 
 
 		 562 aa  159  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  28.64 
 
 		 877 aa  147  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.44 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  28.71 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.04 
 
 		 794 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 835 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  28.44 
 
 		 785 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  28.13 
 
 		 786 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  27.11 
 
 		 783 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  28.57 
 
 		 781 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28 
 
 		 784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  29.59 
 
 		 811 aa  132  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  26.99 
 
 		 852 aa  132  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  25.89 
 
 		 854 aa  130  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  26.12 
 
 		 854 aa  130  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  26.16 
 
 		 781 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  26.28 
 
 		 853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  27.21 
 
 		 882 aa  127  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  27.73 
 
 		 810 aa  126  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  26.61 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  28.02 
 
 		 783 aa  124  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  25.74 
 
 		 607 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  25.93 
 
 		 871 aa  103  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  24.39 
 
 		 1463 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  24.16 
 
 		 941 aa  97.4  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  23.28 
 
 		 1459 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  25 
 
 		 1485 aa  91.7  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  26.81 
 
 		 982 aa  90.5  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  24.45 
 
 		 910 aa  90.5  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.33 
 
 		 821 aa  84  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  22.38 
 
 		 801 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.4 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.86 
 
 		 782 aa  78.2  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  25.47 
 
 		 812 aa  77.8  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  24.86 
 
 		 990 aa  75.5  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.8 
 
 		 1044 aa  75.1  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.38 
 
 		 932 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  23.75 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.91 
 
 		 794 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  23.76 
 
 		 603 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  23.44 
 
 		 809 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 809 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.71 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  23.44 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  23.7 
 
 		 1058 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.94 
 
 		 797 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.86 
 
 		 818 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  25.38 
 
 		 809 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.25 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  19.63 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  25.88 
 
 		 1070 aa  67.4  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.25 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  19.87 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  24.35 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  21.25 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  23.56 
 
 		 929 aa  65.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  22.67 
 
 		 796 aa  64.7  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  27.69 
 
 		 1489 aa  64.7  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.7 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  21.82 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  22.9 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  22.44 
 
 		 1353 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  22.06 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  22.06 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  22.9 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  21.25 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  21.99 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  21.41 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  21.99 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  22.14 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  23.9 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  23.04 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  25.24 
 
 		 1681 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  19.56 
 
 		 788 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  21.54 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  22.84 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  19.47 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  19.47 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  20.86 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  22.96 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  21 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0696  DNA polymerase B region  27.31 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000163547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>