13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0068 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0068  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  314  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  36.27 
 
 		 783 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  36.26 
 
 		 603 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  42.03 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  42.03 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  42.03 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 956 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  30.63 
 
 		 1433 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.12 
 
 		 462 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  32.86 
 
 		 745 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  27.36 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.58 
 
 		 1367 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.58 
 
 		 1367 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>